Существует очень мало информации, которую вы предоставляете, и на самом деле есть учебники по созданию веб-приложений с Eclipse и Java. Вам потребуется версия Eclipse для JavaEE в качестве отправной точки.
Если вы хотите попробовать использовать веб-фреймворк, который работает с Java, я рекомендую Struts, хотя он может быть слишком большим, если вы хотите разрабатывать небольшие веб-приложения (и это не совсем простая вещь для начала).
Я также рекомендую установить Apache Tomcat в качестве сервера, поскольку он бесплатный и простой в использовании. Вот хороший стартовый урок:
http://www.xwt.org/tutorial/eclipse/