Вам нужно составить «белый список» всех переменных, которые устанавливает ваш плагин (я полагаю, вы смотрите на скрипт удаления плагина), а затем просто переберите его на другом конце, чтобы вы могли удалить их все.
Что-то простое, как:
// Somewhere in your plugin, maybe as a class property
$pluginDefinedOptions = array('my_name', 'my_created', 'my_modified'); // etc
// Clear up our settings
foreach($pluginDefinedOptions as $optionName) {
delete_option($optionName);
}
Это единственный способ сохранить код вашего плагина в чистоте.