Сценарий Python уже является «приложением командной строки», которое вы можете поместить в любое место.
Просто установите в первой строке вашего скрипта правильный шебанг, указывающий на ваш интерпретатор Python. Например:
#! /usr/bin/python
(или везде, где OS X помещает свой интерпретатор Python), установите свой скрипт с атрибутами executble и поместите его в папку bin
(он не должен заканчиваться на ".py"либо)