Для аутентификации у вас не возникнет проблем, если все домены являются доверенными - в основном, если сервер Windows примет вход в систему с этого домена, sharepoint также будет работать с ним.
Для получения информации о профиле, импорт из коробки идет в mysites, что является единственной функцией MOSS. Однако нет причин, по которым вы не можете написать собственный код для извлечения данных из AD в профили пользователей WSS.