«Выбор x64 в Build Configuration Manager из моего VS2008 Pro не работает»
Я не уверен, почему вы вообще получаете двоичные файлы, но помните, что инструменты x64 не установлены по умолчанию. Вернитесь и перезапустите программу установки VC2008, выполните выборочную установку и, под битом VC ++ дерева, убедитесь, что установлен флажок для 64-разрядного компилятора. Если это не так, проверьте его и запустите установку. Затем попробуйте свою сборку.
Вам нужны 64-битные версии сторонних библиотек DLL, и вам нужно правильно настроить все пути include и lib и ваши выходные папки, но установка инструмента - это первый шаг.