XPath не определен, кроме как в исходных документах, учитывающих пространство имен. Поэтому простой ответ: в зависимости от реализации может произойти все, что угодно.
По определению, XPath должен работать независимо от настройки isValidating и почти во всех случаях должен давать одинаковые результаты. Исключением может быть использование функции id (), которая зависит от распознаваемых атрибутов ID.