Каждый проект будет иметь запись приложения в IIS.Создайте решение верхнего уровня и добавьте каждый проект, используя пункт меню «Существующий проект -> Добавить» в Solution Explorer в VS.Это единственный способ сделать это, о котором я знаю ...
Я не могу понять, почему проблемы с несколькими приложениями в IIS.