Если вы хотите изменить его с xaml, вы можете это сделать.
<phone:PhoneApplicationPage .........................
xmlns:phone="clr-namespace:Microsoft.Phone.Controls;assembly=Microsoft.Phone"
shell:SystemTray.BackgroundColor="{StaticResource AppThemeColor }"
shell:SystemTray.IsVisible="True">
где "AppThemeColor" - это предопределенный цвет из ресурсов стилей для моего приложения.
И если вы хотите изменить его из кода C #. тогда вы можете использовать следующий код в событии OnNavigatedTo ().
SystemTray.BackgroundColor = Color.FromArgb(255, 250, 110, 40); //background color
SystemTray.ForegroundColor = Color.FromArgb(120, 245, 245, 245);//foreground if you need
SystemTray.Opacity = 0.9; // opacity of background color