Вставьте все, что делает метод main, в нестатический метод класса Main, затем в методе main () создайте экземпляр Main и вызовите метод (предполагается, что аргументы не используются).Затем запустите консоль jmx, найдите свой EJB-компонент и вызовите новый нестатический метод.
Почему вы хотите все это делать - интересный вопрос.