Поскольку в папках содержится коллекция файлов, я очень сомневаюсь в этом, не конвертируя содержимое в один файл (например, сжатый архив zip / rar / 7zip и т. Д.).
Если вы хотитеукажите имя папки и выполните циклический просмотр всех файлов, зашифровывая ее, тогда это может быть один из способов, в противном случае используйте библиотеку zip, чтобы сжать содержимое папки в файл архива и зашифровать это (если библиотека zip еще не включает шифрование AES)