Если проект hadoop похож на проект Java (и, вероятно, так и есть); щелкните правой кнопкой мыши другой проект в проводнике пакетов, выберите свойства, а затем выберите путь сборки Java. После этого нажмите на вкладку «Проекты» и нажмите кнопку «Добавить». Должно появиться диалоговое окно, и вы сможете выбрать свой проект hadoop.
Конечно, оба проекта должны быть в рабочей области.