Нет, они не будут.Но поверьте мне, это будет кошмар, если вы не будете обращать на это внимание, Subversion совсем не умен в таких ситуациях.
Если это вообще возможно, заставляйте их фиксировать каждое изменение, обновляйте вашу рабочую копию и только тогда вы можете начать перетасовывать вещи, не причиняя большого горя.
Делайте что-нибудь еще, и вы облажались.
Я предполагаю, что у вас нет веток, потому чтоесли вы это сделаете, следующее слияние будет болезненным.