Все сводится к личным предпочтениям, у меня была папка «assets» в корневом каталоге вместе с «application» и «system», но в настоящее время я предпочитаю создавать папку «public», поскольку она более семантическая.
Неважно, где вы храните их, выберите имя, которое что-то для вас значит.