Возможно, у вас не установлен модуль CGI для IIS. Снова откройте Microsoft Web Installer. Посмотрите в разделе сервера IIS: CGI и установите его.
Для полноты данных вы можете проверить установленные модули, открыв Диспетчер информационных служб Интернета. Разверните Сайты на свой веб-сайт по умолчанию (или другой сайт, если у вас есть другие настройки). В разделе IIS найдите и откройте модули. Если вы не видите FastCgiModule, вам придется установить его через веб-установщик (похоже, он входит в комплект обычного модуля Cgi).