Если вам известны все URL-адреса интрасети, напишите файл robots.txt (или эквивалентную страницу со всеми URL-адресами и укажите на нее сканер).
Если вы этого не сделаете, вы никогда не сможете быть уверенными в том, что просканировали все URL-адреса, потому что вы не можете проверить это после сканирования.
В последнем случае лучший шанс - выполнить сканирование на максимальной глубине.
Привет