взять подмножество набора данных на основе другого набора данных

Question

предположим, у меня есть один набор данных, который является dat1

ID  block   plot    SPID    TotHeight
1   1   1   4   44.5
2   1   1   4   51
3   1   1   4   28.7
4   1   1   4   24.5
5   1   1   4   27.3
6   1   1   4   20
17  1   10  1   44.5
19  1   10  1   51
1   1   11  21  28.7
2   1   11  21  24.5
3   1   11  21  27.3
4   1   11  21  20
5   1   11  21  12.88666667
6   1   11  21  7.235238095
7   1   11  21  1.583809524

Тогда у меня есть еще один большой набор данных, который является dat2:

ID  block   plot    SPID    Species TotHeight
1   1   1   4   BENI    72
2   1   1   4   BENI    55
3   1   1   4   BENI    51
4   1   1   4   BENI    47
5   1   1   4   BENI    49
6   1   1   4   BENI    34
7   1   1   4   BENI    .
8   1   1   4   BENI    51
9   1   1   4   BENI    66
10  1   1   4   BENI    40
11  1   1   4   BENI    24
12  1   1   4   BENI    62
13  1   1   4   BENI    34
14  1   1   4   BENI    49
15  1   1   4   BENI    57
16  1   1   4   BENI    22
17  1   1   4   BENI    76
18  1   1   4   BENI    56
19  1   1   4   BENI    55
20  1   1   4   BENI    29
21  1   1   4   BENI    24
22  1   1   4   BENI    18
23  1   1   4   BENI    65
24  1   1   4   BENI    55
25  1   1   4   BENI    63
26  1   1   4   BENI    57
27  1   1   4   BENI    57
28  1   1   4   BENI    57
29  1   1   4   BENI    45
30  1   1   4   BENI    83
31  1   1   4   BENI    37
32  1   1   4   BENI    56
33  1   1   4   BENI    65
34  1   1   4   BENI    75
35  1   1   4   BENI    51
36  1   1   4   BENI    .
1   1   2   16  PRSE    141
2   1   2   16  PRSE    192
3   1   2   16  PRSE    .
4   1   2   16  PRSE    197
5   1   2   16  PRSE    172
6   1   2   16  PRSE    143
7   1   2   16  PRSE    141
8   1   2   16  PRSE    155
9   1   2   16  PRSE    167
10  1   2   16  PRSE    155
11  1   2   16  PRSE    175
12  1   2   16  PRSE    190
13  1   2   16  PRSE    148
14  1   2   16  PRSE    180
15  1   2   16  PRSE    .

У меня вопрос, как я могу взять подмножество данных из dat2, в которых ID, блок и график соответствуют данным в dat1? И как я могу получить подмножество данных из dat2, в которых ID, блок и график не совпадают с данными в dat1?

Answer 1

Звучит так, как будто вы хотите merge для идентификатора столбца, блока и графика.

Предполагая, что ваши данные читаются с именами dat1 и dat2, это должно быть то, что вы хотите:

> merge(dat1, dat2, by = c("ID", "block", "plot"))
  ID block plot SPID.x TotHeight.x SPID.y Species TotHeight.y
1  1     1    1      4        44.5      4    BENI          72
2  2     1    1      4        51.0      4    BENI          55
3  3     1    1      4        28.7      4    BENI          51
4  4     1    1      4        24.5      4    BENI          47
5  5     1    1      4        27.3      4    BENI          49
6  6     1    1      4        20.0      4    BENI          34

По сути, это выполняет внутреннее объединение в терминах SQL для трех интересующих столбцов.Прочитайте страницу справки для слияния для левого, правого и внешнего соединения, если это также представляет интерес.

Полностью воспроизводимый гист здесь

Чтобы получить строки, которые не былине сливаются с dat2, этот хак работает.Вероятно, есть более эффективный способ сделать это, но здесь это так.Сначала добавьте параметр all.y = TRUE.Это определяет правое соединение, которое будет возвращать строки из dat2, которые не слились.Тогда мы можем установить это, зная, что строки, которые не слились, вернут NA s:

subset(merge(dat1, dat2, by = c("ID", "block", "plot"), all.y = TRUE), is.na(SPID.x) == TRUE)