Ограничения по стилю, о которых вы упоминаете, относятся только к слоям Fusion Table, созданным с помощью API GMap.Обходной путь должен использовать пользовательский интерфейс Fusion Table.
Например, одна из таблиц, используемых картой газеты, которую вы связали выше, это http://www.google.com/fusiontables/DataSource?dsrcid=552892
Нажмите Визуализировать карту, а затем, если она ваша,выберите Настроить стили.Есть несколько способов установить столько маркеров, сколько вам нужно (при условии, что они являются официальными именами маркеров FT).На основе значений из других столбцов, на основе столбца, содержащего имя маркера и т. Д. Эти стили будут отображаться в вашем приложении GMap.