У меня было похожее сообщение с: use_sudo, true. Решением было добавить это в ~ / .caprc:
default_run_options[:pty] = true
(В качестве альтернативы вы можете вставить в Capfile или config / deploy.rb)
Непонятно, почему вы видите сообщение, но я надеюсь, что описанная выше техника по крайней мере остановит эти сообщения для вас.