Найдите ревизию R, где эти строки существовали, затем используйте
git blame --reverse $R..HEAD <file>
. Это покажет вам, кто их удалил.
Если вы не можете найти такую ревизию, но помнитестрока (скажем, 'test_database'), содержащаяся в пропущенных строках, вы можете использовать функцию кирки для поиска коммитов, включающих эту строку:
git log -Stest_database <file>