В Eclipse невозможно экспортировать несколько проектов без участия человека.
Вы можете написать его, создав файлы ANT build.xml для всех ваших проектов. Файлы сборки ANT позволяют вам указать путь к хранилищу ключей и псевдоним ключа, который вы хотите использовать для подписи вашего APK.
Вы можете создать простой сценарий, который просматривает все ваши проекты и вызывает цель выпуска муравья. Это создаст подписанный файл APK.
Таким образом, вы можете экспортировать все свои приложения одним скриптом.
Более подробную информацию можно найти на:
http://developer.android.com/guide/developing/building/building-cmdline.html