Рассматривали ли вы создание Runnable Jar из затмения.
В eclipse перейдите в File> Export> Java> Runnable Jar.
Там вы найдете несколько вариантов и сможете использовать то, что вам подходит. Созданный jar-файл должен быть в состоянии запустить все сам по себе (очевидно, он требует времени выполнения java).
Попробуйте это.