Итак, ваша цель - сократить время выполнения сценариев или не дать им истечь? Браузеры собираются отказаться от 6-минутного запроса, независимо от того, что вы пытаетесь.
Возможно, попробовать выполнить работу на сервере, а затем опросить ход выполнения запросов AJAX?
Или, если возможно, попробуйте оптимизировать сценарии. Например, если у вас есть какие-то ужасно медленные вещи SQL, попробуйте очистить их.
В противном случае, без дополнительной информации трудно дать более конкретный ответ.