Разрешает ли процесс Adobe Air Native только для вызова .exe-файла только тот, который запускает Java-класс?
А не доступ к определенному методу в Java-классе?
Вы можете запускать приложения Java, запустив java.exe с собственным процессом и передав соответствующие аргументы. См. Запуск Java из cmd .
java.exe