Создайте папку «external library» / «lib» / «library» в корневой папке, добавьте ее в систему контроля версий и ссылки на библиотеки в проектах. С «Скопировать локальный» в справочных свойствах проект автоматически скопирует его в свою папку bin.
Структура нашего проекта:
workspace
config
partial app configs goes here
lib
external libraries goes here
src
Domain
domainProjects
Infrastructure
infrastructureProjects
references 3rd party dll's from lib folder
UI
Tests
solutions
primaryUIapplication
references projects from "src" folder
domainLogic
etc.
В растворе это выглядит так:
_misc
config
tests
Domain
Infrastructure
UI