URL-адрес для setup.exe предназначен только для начальной загрузки. Я обнаружил, что загрузчик, который создается с помощью манифеста развертывания («setup.exe»), предназначен для веб-приложения.
Если ваша публикация clickonce будет установлена на серверах интрасети, вы не сможете использовать встроенный загрузчик. Вы можете написать свой собственный или создать отдельный проект установки для начальной загрузки и вызова .application с установленного сервера при наличии необходимых предварительных условий.
Если вы не полагаетесь на предварительные требования и можете попросить пользователей убедиться, что у них правильная версия CLR, вам не нужен файл setup.exe.