Java представила в R6 update 10 конвейер, который отображает графику на основе Direct3D. Согласно описанию релиза здесь он поддерживает только карты NVidia и ATI, что означает, что у всех, кто не использует эти карты, могут возникнуть проблемы. Поскольку это недавнее нововведение, я бы предположил, что у любого, кто использует старые драйверы для этих карт, также могут быть проблемы. Обновление видеодрайвера, вероятно, исправит первый случай, но не последний.
Если вы установите для sun.java2d.d3d значение false, худшее, что может случиться, - это то, что некоторые пользователи не смогут достичь производительности, которой они теоретически могли бы. Вы должны будете балансировать, является ли это предпочтительным по сравнению с проблемами, которые вы видите в данный момент.