Это не способ записи файлов в Tomcat. Вы делаете HTTP-запрос, который отправляет байты на сервер.
Вы должны создать FileOutputStream(..)
и записать туда байты. Это в случае, если ваш код работает в Tomcat.
Если ваш код представляет собой отдельное приложение, вам необходимо создать сервлет, который может обрабатывать входящий запрос и сохранять файл. Нет прямого способа просто отправить файлы на сервер (и к лучшему - иначе все будут загружать файлы)