Один из вариантов - создать сайт в IIS, который предназначен только для перенаправления на поддомен.
, например, у вас настроены два сайта.
www.example.com (mainapplication example.com (настройте перенаправление на http://www.example.com).
Я немного смущен вашим вопросом. Похоже, ваш сайт полностью публикует или перенаправляет на другой сайт? Какую продолжительность вы установили для сеанса и какой файл cookie?режим вы используете?