Вы можете использовать инструмент SchemaExport . Его можно использовать через командную строку, задачу ant или напрямую использовать SchemaExport Class в коде java.
Вот пример использования класса SchemaExport,
Configuration cfg = new Configuration().configure("your/hibernate/cfg/xml");
SchemaExport schemaExport= new SchemaExport(cfg);
/**First boolean means if print the generated DDL script to the console
Second boolean mean if execute the generated DDL script in the DB*/
schemaExport.create(true, true);
В XML-файле конфигурации hibernate необходимо указать информацию о подключении к базе данных и сгенерированный POJO из сетевых компонентов.