Возможно, вы испытываете состояние гонки при отображении страницы. Если вы используете тег объекта, попробуйте использовать Silverlight.js для загрузки приложения после загрузки страницы.
Если это не поможет, тогда удалите любую логику splash.xaml / javascript и загрузите приложение в чистоте со стандартным экраном загрузки. Если это решение помогает, значит, что-то не так с вашим заставкой.
Дайте этим двум попробовать.