Мне нужно сделать свою Java-программу подключаемым к OME - веб-приложению для обработки изображений с Java API
www.openmicroscopy
OmeroJava - это соответствующий API для последней версии OME (OMERO 4.2), если вы пишете клиент. Если вы хотите встроить свой код в Insight (клиент OMERO Java), вам следует начать с Как написать клиент . Другие ссылки на библиотеки OME-Java предназначены для устаревшей версии и должны использоваться , а не .
Похоже, Open Microscopy Java API заслуживает изучения. Если это не так, стоит подчеркнуть в своем вопросе, почему он не подходит (помечен как устаревший?)