Обычно я запускаю сценарии сборки из командной строки на сервере сборки.
Вы также можете запустить MSBuild с параметром многословия, который увеличивает объем отладочной информации.Это, по крайней мере, даст вам представление о том, в чем проблема, возможно, ваш сервер круиз-контроля в порядке.
msbuild.exe <buildFile.msbuild> /v:d