Насколько мне известно, в Eclipse нет стандартных средств для поддержки "запуска кода X в момент Y", поэтому вам необходимо обратиться к средствам операционной системы.
Если вы можете сделать простую программу, запускаемую с помощью"java -jar" у вас есть много вариантов.Для Windows существует множество различных продуктов EXE-that-launch-jar (мы используем winsw для запуска java как сервисов), и вы можете затем использовать обычное планирование (например, at) для вызова вашего кода.