Просто получите строки из массива:
string[] dates = line.Split(',');
string x = dates[0];
string y = dates[1];
Если может быть несколько запятых, вы должны указать, что вам все равно нужно только две строки:
string[] dates = line.Split(new char[]{','}, 2);
Другаяальтернативой является использование строковых операций:
int index = lines.IndexOf(',');
string x = lines.Substring(0, index);
string y = lines.Substring(index + 1);