Чтобы полностью отключить предупреждение в файле, вы можете добавить следующее в начало файла
#pragma warning(disable:2400)
Если вы хотите большей гибкости, чем полное отключение для файла, на следующей странице перечислены несколько других более детальных параметров.
По вашей информации неясно, является ли это ошибкой в компиляторе или проблемой конфигурации. Я бы склонялся к проблеме конфигурации, в частности к конфликту опций компилятора, который затрудняет подавление предупреждения.
РЕДАКТИРОВАТЬ
ОП упомянул, что они не могут контролировать сгенерированный код, поэтому они не могут напрямую включать прагму. Если это так, попробуйте этот трюк. Скажем, имя файла - Generated.cpp. Больше не включать Generated.cpp в качестве одного из файлов для компиляции. Вместо этого создайте новый файл с именем Example.cpp со следующим содержимым
#pragma warning(disable:2400)
#include "Generated.cpp"
Теперь вы получите текст Generated.cpp с отключенным предупреждением, только скомпилировав Example.cpp.