Обычно Drupal будет связывать логотип с вашей главной страницей, так что это, скорее всего, не проблема jQuery, а проблема CSS.
Есть несколько вещей, связанных с CSS: вы можете переместить логотип в другое местов структуре HTML: $('#logo').appendTo('some selector')
Затем вы должны указать #logo визуально вернуться на свою позицию (например, установить координаты с помощью CSS)
Если по какой-то причине какой-то другой тег находится поверхлоготип, вы можете иметь успех со свойством z-index.