EntityManager
является частью Java Persistence API (JPA).Вы либо настраиваете его самостоятельно, либо ваш сервер (предположительно Glassfish внутри NetBeans?) Настраивает его для вас.
Вот краткий пример того, что вы можете сделать:
Query query = entityManager.createNativeQuery("select name from people");
List<String> results = query.getResultList();
Это более полный пример.