Jar-файлы - это просто замаскированные zip-файлы, поэтому подойдет любой инструмент, который будет искать или индексировать zip-файлы, не разбирая их.
В некотором роде, вы можете просто разбить их в каталог и искать с любымтебе нравится.например, find, xargs и grep.