С какой версией SQuirreL вы работаете? ..
У меня есть 3.2.1, и все, что мне нужно сделать, это нажать на вкладку «Объекты», развернуть соединение, найти базу данных, развернуть ее, а затем поискать «Процедура», затем щелкнуть нужную процедуру и затем нажмите на вкладку «Источник»