Обычно, если вы видите нечто подобное, они говорят о значении пикселя (его интенсивности). Согласно OpenCV значение пикселя рассчитывается как 0,299 R + 0,587 G + 0,114 B. Таким образом OpenCV преобразуется в оттенки серого, кстати. Поэтому, когда они говорят о сумме пикселей, они, скорее всего, говорят о сумме значений пикселей в данной области (то есть для области 3x3, взять значение каждого пикселя и суммировать его).