Самый простой способ - создать сценарий оболочки.
Сделайте так, чтобы скрипт оболочки экспортировал вашу новую переменную LD_LIBRARY_PATH, затем запустите ваше приложение
например. (где foo ваше приложение)
#!/bin/sh
LD_LIBRARY_PATH=some_path:$LD_LIBRARY_PATH
export LD_LIBRARY_PATH
foo