Я также новичок в iCloud, но, насколько я понял, должна быть возможна чистая резервная копия:
Возможны разные варианты, но в нижней части ваша базовая реализация данных, скорее всего, будет использовать файл SQLite для хранения своих данных. Чтобы создать резервную копию этого файла, просто скопируйте его в каталог внутри каталога iCloud (каталог, указанный URL-адресом, полученным из URLForUbiquityContainerIdentifier.
Как указывалось ранее, я тоже новичок в этой теме. Таким образом, есть большая вероятность, что я говорю глупости. Но если это не так, это может быть то, на что вы смотрите, и стоит попробовать.