Вам нужно использовать Debug-> Step Into вместо кнопки панели инструментов «Debug Main project» для одиночного перехода к работе.Это связано с несовместимостью Netbeans с более новыми версиями GDB (я попробовал 7,2).
Еще один недостаток, который я обнаружил при отладке кода C ++ из Netbeans, заключается в том, что иногда он зависает при запуске, если вы наблюдаете некоторые переменные.Удалите все выражения часов, и отладчик работает нормально.