Вы имеете в виду что-то вроде этого:
function openWin(){
myWindow=window.open("http://www.google.co.uk","","width=200,height=100");
}
function closeWin(){
if(myWindow){
myWindow.close();
}
}
подключен к этим кнопкам:
<input type="button" value="Open 'myWindow'" onclick="openWin()" />
<input type="button" value="Close 'myWindow'" onclick="closeWin()" />
немного грубовато, но должно сработать ... Я бы тоже сделал это ненавязчивым, если бы я был тобой, я использовал навязчивый код, чтобы быстро получить ответ