Да, вы можете изменить DOM после создания диалога. Я сделал небольшой пример для вас, чтобы вы могли получить подсказку о том, как это сделать
http://jsfiddle.net/CH5Yp/
$(function() {
$( "#dialog" ).dialog({
create: function(){
var logo = $("<div/>").addClass("logo");
$(this).append(logo);
}
});
});
И CSS
.logo{
background: #FF0000;
width:50px;
height:10px;
position:absolute;
top:0px;
left:0px;
}