Скорее всего, это ошибка - svcutil не «реорганизует» схемы. Если вам нужен инструмент, который обрабатывает этот вид работы, а больше ему нравится, этот инструмент рефакторинга XML Schema должен помочь. Загрузите, установите и создайте новый файл рефакторинга схемы XML (.xsr); добавить новую коллекцию XML Schema; щелкните правой кнопкой мыши версию 1.0, выберите команду [Импортировать файлы схемы ...] и следуйте инструкциям. Он может «красть» онлайновые схемы, в том числе ссылки на файлы WSDL или встроенные в них и т. Д.