На самом деле вы можете иметь несколько проектов запуска в решении VS, поэтому ваше приложение может быть добавлено дважды.
Щелкните правой кнопкой мыши решение и выберите Set Startup Projects.... Убедитесь, что в этом диалоговом окне выбрана радиокнопка Single startup project и что раскрывающийся список указывает на ваш проект.
Если в данный момент настроено ваше приложение, я бы выбрал другой проект, сохранил бы, а затем повторно выбрал ваш текущий проект в надежде, что, возможно, VS удалит все неверные настройки.
Обратите внимание, что эта информация хранится в файле .suo, связанном с вашим решением, поэтому другое возможное решение - закрыть решение, удалить этот файл и снова открыть решение. У меня было более одной необъяснимой проблемы, исправленной путем удаления этого файла.