При проверке открывается веб-инспектор в Chrome / Safari или Firebug в Firefox, который занимает некоторую часть области просмотра и запускает событие изменения размера окна (даже если окно не изменило размер, насколько это касается ОС, из у вашего документа есть точка зрения).
Я бы добавил вызов к matchColumns, который запускается сразу, в дополнение к вызовам, которые запускаются при изменении размера. Так как:
$j(window).resize(function() {
$j('#layer-base, #layer-top, .exposed, ').matchColumns();
});
$j('#layer-base, #layer-top, .exposed, ').matchColumns();
Или, что еще лучше, выделите эту строку в функцию.