Ваше единственное реальное ограничение в отношении доступа к данным - это то, что вы ограничены базой данных SQLite, что, честно говоря, не является большим ограничением, поскольку оно отлично подходит для однопользовательского доступа.
Суть в том, что у вас есть доступ к базе данных из вашего приложения, так что вы можете делать все, что вам нужно. Инструменты - это HTML & JS, в отличие от C # с некоторым графическим слоем, поэтому такие вещи, как создание графиков, совсем другие, но все это возможно.
Также обратите внимание, что в зависимости от того, что делает ваше приложение, PhoneGap является одним из нескольких решений. Если вам нужен «родной» внешний вид, подумайте о TitaniumUI - он берет общий код (все еще JS) и проталкивает его через несколько уровней перевода для создания собственных компонентов пользовательского интерфейса.