Зависит от браузера. Метатег не будет влиять на сценарии, только на саму страницу. Вам нужно изменить настройки сервера, чтобы отправить заголовок без кэширования для JavaScript:
http://en.wikipedia.org/wiki/List_of_HTTP_header_fields#Avoiding_caching
Кроме того, лучший способ предотвратить кэширование JavaScript вашим браузером, когда вы выпускаете новую версию, - это версия скриптов. Не уверен, используете ли вы какую-то автоматическую сборку, но если это так, то довольно легко настроить версионный JavaScript / CSS.